Tanto Kakashi como Danzou tinham obtido fisicamente o seu Sharingan através de transplante.
Durante o final da Quarta Guerra Mundial Shinobi, Madara rasga o Sharingan de Kakashi e transplanta como seu olho esquerdo Capítulo 674 ).
Naruto, usando o poder de Hagaromo, cria um olho normal para Kakashi Capítulo 675 ).
Do artigo de Naruto Wikia sobre Kakashi Hatake , resumo da trama fundida dos capítulos 686, 687 e 688 (mina de ênfase):
Preparado para dar a sua vida para dar a pouca ajuda que puder, Kakashi coloca-se em frente a Sasuke para tomar o ataque enquanto Obito faz o mesmo por Naruto. Embora estejam unidos na sua vontade de morrer, Obito decide que é demasiado cedo para Kakashi e usa Kamui no ataque que lhe é destinado, deixando Obito incapaz de se salvar. O corpo de Obito dissolve-se, mas o seu espírito regressa pouco depois e habita Kakashi. Obito sente que Kakashi se tornará o próximo Hokage e deseja recompensá-lo: *um momento temporário de ter dois Mangekyō Sharingan***.
Obito deu a Kakashi o privilégio de ter ambos Sharingan (Mangekyou) temporariamente. Isto foi obra do espírito de Obito e não do eu físico. Assim, o Sharingan Kakashi utilizado foi espiritualmente influenciado.
Mais tarde, quando Kaguya é derrotado, o espírito de Obito deixa o lado de Kakashi para se juntar ao outro mundo. Devido à partida do espírito, o Sharingan também desaparece juntamente com ele.
Se o Sharingan estivesse fisicamente presente, teria ficado, tal como Danzou, o corvo Kotoamatsukami e o Kakashi pré-guerra.